Der Grund für das Zustandekommen von Fluoreszenz sind Defekte in der Kristallstruktur des jeweiligen Minerals oder Einschlüsse von Fremdsubstanzen. Diese bewirken das Aufleuchten, das je nach Substanz die Farbe Weiß, Blau, Grün, Rot, Orange oder Gelb annimmt. Das unterschiedliche Fluoreszenz-Verhalten von ansonsten gleichfarbigen Mineralien unter Einwirkung von UV-Strahlung kann hilfreich sein, diese auseinanderhalten zu können. Bislang weiß man von ungefähr 200 Mineralen, bei welchen dieses Phänomen auftreten kann, allerdings in unterschiedlich starker Ausprägung.
Von der
Phosphoreszenz unterscheidet sich die Fluoreszenz dadurch, dass der Lichteffekt nur für die Dauer der Bestrahlung anhält; bei der Phosphoreszenz hingegen kann es zu einem Nachleuchten über mehrere Stunden hinweg kommen.